1.进样口与检测器处容易漏气。在线气相色谱的进样口类型多种多样，常见的为填充柱进样口和毛细柱进样口。其中，毛细柱进样口设计复杂，流路较多，又需要在高温下工作，发生漏气的可能性大。另外，如FID检测器的喷嘴密封等也是经常发生漏气的地方，喷嘴密封的石墨垫多次使用后可能破损，容易发生漏气。
2.色谱柱安装不当容易漏气。色谱柱是在线气相色谱仪分离的核心，一般使用螺帽和石墨压环（或者金属材质、聚酰亚胺/石墨材质等）将色谱柱固定在进样口和检测器上，往往由于石墨压环不匹配、安装错误、多次使用、螺帽过紧或者松动等问题引起色谱柱安装漏气。不同型号 在线气相色谱仪的进样口毛细柱石墨压环外形往往不同，如果混用，往往会引起漏气。
3.色谱柱螺帽过紧或者松动容易发生漏气。当安装色谱柱时候，一方面，由于石墨材质柔软，过度拧紧会导致石墨被挤压超过它们的设计规格，引起溢出或者布满密封接口，很快出现泄漏且频率更高；再者，石墨被过度拧紧可能会堵塞色谱柱与进样口的连接接头，引起其他问题。当安装色谱柱时候，色谱柱螺帽松动往往并不发生于安装过程，多数是由于色谱仪柱温箱长期反复升温和降温的情况下，基于热胀冷缩的作用，拧紧的螺帽可能会变松，因此应当定期进行检查和拧紧。
